Длясохранения водно-болотных угодий оз. Ханка в бассейне озера были созданы два заповедника:

• - с российской стороны - Государственный природный заповедник «Ханкайский» (1990 г.);
• - с китайской стороны (провинция Хэйлунцзян) - заповедник «Синкай-Ху» (1986 г.), с 1994 г. наделенный статусом национального резервата.

Уже с начала 90-х годов прошлого столетия началось становление партнерских взаимоотношений между российским природным заповедником «Ханкайский» и китайским резерватом «Синкай-Ху». Подписанное же 25 апреля 1996 года между Правительствами Российской Федерации и Китайской Народной Республики Соглашение о создании на базе двух соседствующих природоохранных организаций международного заповедника «Озеро Ханка» позволило приступить к более тесному и планомерному российско-китайскому сотрудничеству, направленному на охрану флоры, фауны и природных экосистем бассейна озера Ханка, на развитие двустороннего взаимодействия в области охраны окружающей природной среды и рационального использования ее ресурсов, долгосрочного мониторинга и изучения природных экосистем.

С момента образования трансграничного заповедника и до принятия Общей программы сотрудничества (2009) состоялось более 15 встреч, в которых с российской стороны участвовали представители органов власти и природоохранных структур, ученые и общественные деятели. Во время встреч подписано несколько договоров и протоколов по вопросам регламента и перспектив дальнейшего сотрудничества: В августе 2003 года в г. Москве состоялось заседание Смешанной российско-китайской рабочей группы по охране окружающей среды (при Правительствах РФ и КНР), оживившее совместную международную деятельность двух заповедников.

В октябре 2003 года в г. Мишане, КНР, прошло рабочее совещание по активизации действий международного заповедника «Озеро Ханка».

В сентябре 2004 года на базе Хинганского заповедника (Амурская область) с последующим посещением резерватов северо-восточного Китая прошел международный семинар, посвященный проблемам сохранения биоразнообразия на трансграничных территориях (приняли участие представители международного заповедника «Озеро Ханка»),

В марте 2005 года в заповеднике «Синкай-Ху» проведен российско-китайский семинар по организации совместных научных исследований.

В июле 2005 года в г. Спасске-Дальнем состоялось рабочее международное совещание по взаимодействию в области охраны и рационального использования природных ресурсов в бассейне озера Ханка с участием делегации Собрания народных представителей провинции Хэйлунцзян и российских представителей Смешанной комиссии международного заповедника «Озеро Ханка».

В сентябре 2005 года в г. Спасске-Дальнем состоялось рабочее совещание по вопросам сохранения водно-болотных угодий бассейна озера Ханка. Во встрече участвовали сотрудники МАБ КНР.

В июне 2006 года в г. Спасске-Дальнем состоялась вторая международная научно-практическая конференция «Проблемы сохранения водно-болотных угодий международного значения: озеро Ханка», посвященная 15-летию заповедника «Ханкайский» и 10-летию международного заповедника «Озеро Ханка».

В честь 10-летия международного заповедника «Озеро Ханка» в 2006 году в г. Спасске-Дальнем (РФ), и г. Мишане, КНР, проводились выставки рисунков российских и китайских школьников.

В сентябре 2007 года в г. Москве состоялось Международное российско-китайское совещание «Состояние и перспективы российско-китайского сотрудничества в области охраны окружающей среды и управления водными ресурсами».

Рабочая группа по вопросам трансграничных особо охраняемых природных территорий и сохранения биологического разнообразия.

Вмае 2007 года в г. Харбине прошло первое заседание Рабочей группы по вопросам трансграничных особо охраняемых природных территорий и сохранения биологического разнообразия Подкомиссии по сотрудничеству в области охраны окружающей среды Комиссии по подготовке регулярных встреч глав правительств России и Китая.

С тех пор заседания этой Рабочей группы проводятся ежегодно. Во время заседаний стороны обмениваются информацией о проделанной работе, о результатах сотрудничества, обсуждают возникающие в процессе работы вопросы и согласовывают план работ на предстоящий год.

Начиная с 2006 года 25 апреля на российской части территории бассейна озера Ханка регулярно осуществляется празднование совместного российско-китайского экологического праздника «День озера Ханка».

Идея праздника была разработана и одобрена двумя сторонами и направлена на привлечение внимания местного населения и широкой общественности России и Китая к проблемам сохранения уникальной природы озера.

Как правило, празднику приурочены тематические встречи и беседы со школьниками, студентами, представителями трудовых и общественных коллективов, разнообразные творческие конкурсы, выставки, концертные выступления и фестивали экологических агитбригад. Так, например, в 2009 году в рамках «Дня озера Ханка» в краеведческом музее г. Спасска-Дальнего демонстрировалась региональная выставка фотографий, подготовленных сотрудниками заповедников и национальных парков юга Дальнего Востока России, «Заповедники - острова жизни».

В 2011 году по инициативе специалистов Ханкайского заповедника и Управления образования Спасского муниципального района в школах Спасского района прошел конкурс детских компьютерных презентаций «Экологический репортаж». В своих докладах школьники постарались представить слушателям материалы о природных достопримечательностях Приханкайской низменности и изложить проблемы, связанные с их сохранением.

В 2017 году совместное празднование прошло на территории китайского сектора заповедника «Озеро Ханка» в рамках встречи коллег из заповедника «Ханкайский» и биосферного резервата «Синкай-Ху». В праздничном выступлении приняли участие творческие коллективы из КНР. После состоялось вручение грамот победителям конкурса детского изобразительного творчества из числа китайских школьников и педагогов. Также была проведена выставка детских рисунков победителей международного конкурса «Ханка в ладонях». Лучшие российские работы были привезены для участия в совместной выставке детских рисунков.

Мероприятия, проводимые в рамках праздника «День озера Ханка», освящаются в печатных средствах массовой информации и по каналу местного телевидения г. Спасска-Дальнего и Спасского района, а также на официальном сайте заповедника Ханкайский».

Смешанная комиссия по реализации соглашения между правительством РФ и правительством КНР о заповеднике «Озеро Ханка».

С 26 по 27 марта 2009 г. в г. Харбине состоялось Первое совместное заседание Смешанной комиссии. В ходе заседания был утвержден ряд документов по регламентации деятельности комиссии - Положение о Смешанной Российско-Китайской комиссии по реализации соглашения между правительством РФ и правительством КНР о заповеднике «Озеро Ханка», Решение о создании Рабочей группы в рамках Смешанной комиссии по осуществлению Плана действий, а также принята Общая программа сотрудничества заповедника «Озеро Ханка» на 2009-2010 гг. Цель программы - активизация совместной деятельности двух заповедников.

Что касается проведения совместных мероприятий, то наибольшие результаты достигнуты в области экологического просвещения и научного сотрудничества (орнитология и ихтиология).

В рамках реализации Общей программы сотрудничества были проведены следующие мероприятия:

С 29 марта по 1 апреля 2010 г. на базе заповедника «Ханкайский» состоялся семинар орнитологов международного заповедника «Озеро Ханка», в работе которого участвовали 5 китайских и 6 российских сотрудников заповедников. На семинаре обсудили современное видовое разнообразие, состояние редких, водоплавающих и зимующих птиц, а также вопросы по их охране в российском и китайском секторах международного заповедника. В ходе заседаний специалисты обменялись опытом по ведению орнитологических исследований и пришли к выводу, что учеты ценных и редких видов птиц необходимо проводить по единым методикам.

С 2 по 4 апреля 2010 г. в российском секторе международного заповедника «Озеро Ханка» были проведены совместные учеты журавлей и водоплавающих птиц.

С 21 по 28 октября 2010 г. на базе Национального природного резервата «Синкай-Ху» (Китай, провинция Хэйлунцзян, г. Мишань) состоялся российско-китайский научно-практический семинар «Проблемы мониторинга птиц в бассейне оз. Ханка и долины р. Сунгача». В работе принимали участие 4 орнитолога заповедника «Ханкайский» и 7 коллег из Китая. Полевые мониторинговые работы в различном временном регламенте затрагивали все дни пребывания с 21 по 28 октября. За период работ было встречено, либо были выявлены признаки нахождения (гнёзда или перья) 92 видов птиц. В их числе оказалось 9 видов, ранее отсутствующих в авифаунистическом списке Национального резервата «Синкай-Ху», составленном китайскими орнитологами. К наиболее интересным авифаунистическим находкам можно причислить встречи двух новых видов особо охраняемых птиц - тростниковой суторы и китайского ремеза.

Несмотря на то, что сроки реализации Общей программы сотрудничества, принятой на Первом заседании Смешанной комиссии, ограничивались 2010 годом, сотрудничество заповедников «Ханкайский» и «Синкай-Ху» продолжилось и в дальнейшем.

С 5 по 10 сентября 2011 г. на территории национального природного резервата «Синкай-Ху» прошел российско-китайский семинар по вопросам ихтиологии российско-китайского заповедника «Озеро Ханка», в работе которого, кроме сотрудников заповедников «Ханкайский» и «Синкай Ху», приняли участие старший научный сотрудник лаборатории ихтиологии Зоологического института РАН A.M. Насека и профессор Института водных исследований Северо-восточного университета лесного хозяйства ЮйХунсянь. Во время семинара были организованы выезды на водоемы заповедника «Синкай-Ху», в ходе которых осуществлялись инвентаризационные работы, и на живом материале была обсуждена систематика некоторых представителей ихтиофауны оз. Ханка. По результатам встречи в конце 2011 г. российскими ихтиологами подготовлен отчет «Круглоротые и рыбы бассейна озера Ханка, реки Сунгача и их состояние на акватории российско-китайского заповедника «Озеро Ханка». Кроме того, ихтиологом Ханкайского заповедника собрана информация по современному состоянию редких видов рыб в китайском секторе бассейна, которые внесены в Красную книгу Российской Федерации.

С 28 сентября по 4 октября 2011 г. на территории национального природного резервата «Синкай-Ху» прошел российско-китайский полевой семинар по вопросам проведения осеннего мониторинга перелетных птиц. В результате утвержден Список птиц российско-китайского заповедника «Озеро Ханка». Также в ходе проведения полевых работ на территории «Синкай-Ху» российскими орнитологами обнаружены 5 новых видов, ранее отсутствующих в списке птиц этого заповедника.

В декабре 2011 г. был издан буклет «Российско-китайский заповедник «Озеро Ханка» на русском языке тиражом 1000 экземпляров. В декабре 2012 года аналогичный буклет был издан на английском языке тиражом 1300 экземпляров.

С 15 по 18 июля 2012 г. на китайском побережье озера Ханка прошёл международный экологический Форум «Экологически безопасное развитие озера Ханка на территории Китайской Народной Республики на 2012 год». Наряду с многочисленными участниками из Китая и зарубежных государств в его работе принимали участие и сотрудники государственного природного заповедника «Ханкайский». В рамках Форума в офисе китайского заповедника «Синкай-Ху» состоялось двустороннее рабочее совещание с участием 5 сотрудников государственного природного заповедника «Ханкайский» и 15 специалистов заповедника «Синкай-Ху» по оценке достигнутых результатов российско-китайского взаимодействия в области организации деятельности международного заповедника «Озеро Ханка» и согласования планов дальнейшего сотрудничества.

В сентябре 2013г. сотрудники заповедника «Ханкайский» приняли участие в ИнтернациональномЭкологическом форуме (CMF) на базе национального природного заповедника «Чанбайшань», КНР.

Второе заседание Смешанной комиссии состоялось в 2016г. в г.Владивостоке Приморского края (Российская Федерация). По результатам заседания был утвержден план совместных действий по реализации межправительственного Соглашения о заповеднике «Озеро Ханка». В рамках исполнения данного плана также проводились различные встречи и мероприятия.

В конце апреля 2017 года российская делегация в составе сотрудников государственного природного заповедника «Ханкайский» посетила китайский заповедник «Синкай-Ху». Партнёры провели совместное рабочее совещание, где познакомили друг друга с ведущими направлениями научных исследований на заповедной территории, с успешно применяемыми формами и методами взаимодействия с населением.

В мае 2017г. в провинции Хэйлунцзян (г.Жаохе, КНР) прошла 36-ая Неделя любителей птиц с целью ознакомления с зарубежным опытом работы национальных парков и заповедников.

В октябре 2019 года старший научный сотрудник заповедника «Ханкайский» посетил китайский резерват. В ходе поездки были проведены совместные учеты, а также мечение птиц GPS-GSMТрекерами для отслеживания путей их миграции. Кроме того, состоялось рабочее совещание по вопросам дальнейшего сотрудничества, в ходе которого были достигнуты соглашения, касающиеся учетов редких видов птиц на территории обоих заповедников, издания совместных трудов и изучения миграции некоторых видов птиц с использованием GPS-GSMТрекеров.

В октябре 2022г. в формате видеоконференции состоялось третье заседание Смешанной комиссии. Стороны обменялись достигнутыми за прошедшие годы результатами в различных направлениях деятельности, а также обсудили планы дальнейших работ.

В целом можно сказать, что как в российском, так и китайском секторе международного заповедника «Озеро Ханка» ведётся активная работа по сохранению водно-болотных угодий оз.Ханка, которую необходимо продолжать и в дальнейшем, развивая совместное сотрудничество.

Иные международные программы с участием заповедника «Ханкайский».

Программа по мечению птенцов дальневосточного аиста спутниковыми передатчиками (в рамках Меморандума о совместной работе по изучению миграции дальневосточного аиста между Научно-исследовательским центром экологии и окружающей среды Китайской Академии Наук, заповедником «Хунхэ», Координационным советом директоров заповедников юга Дальнего Востока, ФГБУ «Заповедное Приамурье»). По данной программе сотрудниками заповедника в 2018 году было проведено мечение 7 (семи) птенцов дальневосточного аиста.

С 2019 года в границах заповедника ведутся ежегодные работы по выявлению наличия вируса птичьего гриппа и возможности его циркуляции и распространения в местах отдыха и кормления гусеобразных, в частности диких уток. В августе 2019 года данные работы проводились совместно со специалистами Корейского института окружающей среды (Южная Корея).